蘋果公司研究員菲爾-席勒（PhilSchiller）警告說，盡管蘋果公司試圖在監管規則全面生效之前加強安全性，但在歐盟國傢為iPhone引入第三方應用程序市場可能會給用戶帶來巨大的隱私和安全問題。
《歐盟數字市場法》（EU Digital Markets Act，DMA）迫使蘋果公司在歐盟成員國向第三方數字店面開放iPhone，從2024 年 3 月起，在iOS 17.4更新中，除蘋果公司自己的App Store之外，還將啟用側載和替代商店。
為準備引入第三方商店，蘋果公司已經概述各種收費方式的變化，以及確保用戶安全的安全機制。不過，蘋果公司警告說，這並不能防范所有可能發生的情況。
App Store 負責人、蘋果公司研究員菲爾-席勒（Phil Schiller）向《Fast Company》解釋說："這些新規定在為開發者帶來新選擇的同時，也帶來新風險。這是無法回避的問題。因此，我們正在盡一切努力將這些風險降到最低。"
第三方店面的引入意味著在 iPhone 上安裝帶有惡意代碼的應用程序有新的途徑，這可能會給最終用戶帶來許多問題。蘋果公司舊有的"圍墻花園"方法和 App Store 審查程序會淘汰這些應用程序，2022 年將有近 170 萬個提交的應用程序因不符合隱私、安全和內容標準而被拒絕。
由於第三方商店的審查程序可能沒有蘋果公司那麼嚴格，蘋果引入各種元素來提高安全性，比如在 iPhone 上安裝所有應用程序之前都要進行公證，無論這些應用程序來自哪個應用程序商店。
席勒說："我們為開發者提供 600 多個新的 API，為他們提供建立市場、安裝應用、讓用戶控制這一過程的工具。我們已經完成大量的核心工程，並將繼續下去。"
用戶在安裝應用程序前還會看到一張信息表，顯示應用程序的基本詳情，並增加對市場選擇的更多控制。
盡管如此，席勒補充說，蘋果的保護措施也有局限性，它無法真正控制替代店面的應用程序內容，因為公證並不檢查實際內容，隻檢查應用程序是否安全和沒有惡意。
蘋果公司的研究員說："歸根結底，有些東西我們不允許出現在我們的 App Store 上--我們認為這些東西不安全或不合適。其他市場是否也有同樣的條款和限制，這不是我們能決定的"。
席勒指出："雖然蘋果公司在多年征求傢庭和政府意見後制定規則，防止特定類型的不良內容出現在 App Store 中，但這些規則並不適用於其他市場，除非他們選擇制定自己的規則，並采用他們提出的任何標準。這會增加用戶和傢庭遇到不良內容或其他經歷的風險嗎？是的，會。"